小黑杨HD-Zip转录因子PsnHB63基因克隆及表达分析

doi:10.7525/j.issn.1673-5102.2021.06.019

摘要/Abstract

摘要：

该研究克隆小黑杨（Populus simonii × P. nigra）叶片的PsnHB63基因，生物信息学分析到全长cDNA片段长717 bp，推测编码238个氨基酸，并具有Homeobox/HALZ家族保守结构域的不稳定亲水蛋白。PsnHB63系统进化树与毛果杨、银白杨、胡杨亲缘关系较近。亚细胞定位认证表明定位于细胞核中。在盐和干旱胁迫下，基因均上调表达。表明HD-Zip转录因子PsnHB63基因可能与植物应答高盐和干旱胁迫相关。

关键词: 小黑杨, 转录因子, 亚细胞定位, 胁迫应答

Abstract:

The PsnHB63 gene was cloned from the leaves of Populus simonii × P.nigra， and by using bioinformatics analysis， the results showed that the full-length cDNA fragment was 717 bp in length， encoded 238 amino acids， and had an unstable hydrophilic protein with a conserved domain， belonged to Homeobox/HALZ family. The phylogenetic tree showed that PsnHB63 was closely related to Populus tomentosa， Populus alba and Populus. The PsnHB63 was localized in the nucleus by subcellular localization. Under salt and drought stresses， the expression of PsnHB63 was up-regulated. The results indicated that the HD-Zip transcription factor HB63 might respond to high salt and drought stresses.

Key words: Populus simonii × P.nigra, transcription factors, subcellular localization, stress response

中图分类号:

S792.116

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参考文献 39

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引物 Primer	引物序列 Primer Sequence
HB63-F	TCAGACCAGGAACCAAGGCTT
HB63-R	TCCTCTCCGATGGTCTCTCTG
HB63-GFP-F	GCTCTAGAATGTTTGATGGAGGAGAGTATTCAC
HB63-GFP-R	GACTAGTAGCCCAGAAATCCCACCACT
HB63-RT-F	AGGAAGGAGAGTGTTGTGGCC
HB63-RT-R	AGGTTCGGTTCTTCTTCGAG
pBI121-F	CCATCGTTGAAGATGCCTCTGC
pBI121-R	CTCTTCGCTATTACGCCAGCTG
ACT-F	ACCCTCCAATCCAGACACTG
ACT-R	TTGCTGACCGTATGAGCAAG

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